蛋白质序列PIR和PDB使用方法 编程开发

蛋白质序列PIR和PDB使用方法

-2022年5月14日发(作者:祖庚)摘要随着核酸数据库不断发展以及数据库的建立,蛋白质序列、结构、功能不断引起人们的重视,生命科学的研究中蛋白质的研究显得尤为重要,一系列的蛋白质序列数据随之产生,数据库也在研究蛋白质的过程中有着不可或缺的地位。本文主要通过实验说明蛋白质序列数据库PIR及蛋白质结构数据库PDB的使用方法,返回结果的含义,以及如何下载数据和批量下载数据。前言由于蛋白质序列测定技术先

vmd指南 网络技术

vmd指南

-2022年5月14日发(作者:萧玉)Auto-Psfbuilder它可以自动为已知的pdb文件生成psf文件(自动添加H),但需要已知pdb文件中所有残基的top文件,top文件的格式为charmm。操作步骤:在Vmd的主菜单下选择File–newmolecule–browse选项,从窗口中选择pdb文件注意:vmd不能识别中文目录选择HDL_,点load。这样我们就能在图像窗口中看到载入的分子

VC的工程设置解读Project—Settings 编程开发

VC的工程设置解读Project—Settings

-2022年5月14日发(作者:方畅熙)VC的工程设置解读Project—SettingsVC工程设置可能会直接影响到工程的正确性,有时是BUG产生的直接原因,在出现莫名其妙的错误,首先应考虑到是否是工程设置有问题,这无论对于开发还是测试,都是很必要的,本文大致介绍一下工程设置选项。工程选项的快捷建是Alt+F7,左边的列表可以选择要设置的工程编译方式(Debug或Release),如果多个工程,

NAMD入门教程(一)-图文 编程开发

NAMD入门教程(一)-图文

-2022年5月14日发(作者:方兆祥)NAMD入门教程(一)-图文预定目录1.分子动力学模拟概论1.1分子动力学模拟的发展1.2分子动力学模拟的基本原理1.3分子动力学模拟相关软件2.分子动力学入门2.1基本设置2.2生成蛋白质结构文件(PSF)2.3蛋白质的溶质化2.4球状水体中泛素(Ubiquitin)的分子动力学模拟2.5立方水体中泛素(Ubiquitin)的分子动力学模拟2.6简单的结果

gromacs中文教程 网络技术

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-2022年5月14日发(作者:吕同老)GROMACS 教程 GROMACSIntroductoryTutorialGromacsver4.0Author:an,Ph.D.AssociateDirector,BioinformaticsTheCancerInstituteofNJ195LittleAlbanyStreetNewBrunswick,NJ08903Phone:Fax:Email:(73

GROMACS使用教程 编程开发

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-2022年5月14日发(作者:许佳蓉).GROMACS教程一Gromacs基本模拟流程.............................................41下载pdb文件..................................................42用pdb2gmx处理pdb文件...................................

最全电子书 编程开发

最全电子书

-2022年5月14日发(作者:时逸之)最全电子书悉心整理(郭东旭)★★★★★电子书制作全能高手进阶教程(内含大量实用资源,是我在飞力网上的个人原创贴,强烈吐血推荐!)一提到Palm上使用得最多的功能,毫无疑问是电子书阅读功能了。Palm上的电子书阅读,也是八仙过海,各显神通,最常用的有HandStory、Isilo、CSpotRun、Qed、TealDoc等等,每个都有自己的长处与优点,其共同点

Gromacs教程II-MD结果分析 网络技术

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-2022年5月14日发(作者:于明)Gromacs中文教程(II):结果分析淮海一粟MD结果分析模拟结束后,就可以分析数据了。分析包括三个阶段。首先,有必要对模拟的质量进行检查,如果检查结果表明模拟良好,那么就可利用该模拟对所研究的问题作出回答;最后,不同的模拟结果可以合并。注:文件名应该反映文件内容,这根据你的模拟系统不同而不同。这里我们假定使用默认文件名,那么就会产生以下文件:••••••:

常用的生物信息学软件的介绍和文献依据 网络技术

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-2022年5月14日发(作者:席承藩)名称简介参考备文献注一个产生出版质量比对的“所见即所得”ALINE蛋白质-序列比对编辑器用于自动微阵列数据分析的一个R包访问本体论和注释数据基因组注释绘图库,基因组特征可视化代谢通路的一个可视化工具,翻译文本的生物学网络描述为图示下一代测序数据片段的最佳延长及准确提取和可视化将ArrayExpress数据集导入到R/Bioconductor中用于RNA-se

linux下Rosetta从头预测软件的安装使用 网络技术

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-2022年5月14日发(作者:叶永明)1、(平台:Fedora10,gcc版本为4.3.2)安装Rosetta需要另外一个名为scons的软件,到下载rpm包,在根口令下安装(输入:rpm-ivh软件包名称)进入/,点击software,在DownloadRosettaSoftware下方点击AcademicUsersLogon(事先注册好非商业性邮箱得到帐号与密码,我注册的是雅虎邮箱,下载的版

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